Сама по себе ИКСИ не делает эмбрион "более качественным" — метод решает конкретную проблему с оплодотворением, но не устраняет возрастные или иные причины возможных неудач ЭКО. При этом дополнительный протокол ИКСИ позволяет добиться зачатия даже там, где естественное слияние половых клеток родителей физически невозможно — например, при выраженном мужском бесплодии.
Что касается безопасности для будущего ребёнка — крупные многолетние наблюдения не выявили значимого повышения рисков врождённых патологий у детей, рождённых после ИКСИ, по сравнению с детьми, зачатыми естественным путём или классическим ЭКО, при условии, что показания к процедуре определены правильно.