Эмбриолог оценивает развитие и качество эмбрионов, а репродуктолог — готовность пациентки к процедуре. Если проводилось ПГТ, при выборе эмбриона учитываются результат анализа и ограничения этого исследования. Оценки внешнего вида эмбриона недостаточно, чтобы определить все его генетические особенности или предсказать исход беременности.
Для переноса необходимо соответствие стадии развития эмбриона и состояния эндометрия. С учётом этих данных репродуктолог назначает дату процедуры. При гормональной подготовке эндометрия нельзя самостоятельно менять время приёма препаратов, в том числе начало и продолжительность применения прогестерона.
Количество эмбрионов для переноса репродуктолог обсуждает с пациенткой отдельно. Перенос большего числа эмбрионов повышает риск многоплодной беременности. Вероятность рождения ребёнка при этом не обязательно увеличивается в той же степени. Решение принимается с учётом медицинских показаний и согласия пациентки.